This function is a wrapper function around the functions read_PSL2R and
write_RLum2CSV and it imports an PSL-file (SUERC portable OSL reader file format)
and directly exports its content to CSV-files.
If nothing is set for the argument path (write_RLum2CSV) the input folder will
become the output folder.
convert_PSL2CSV(file, extract_raw_data = FALSE, single_table = FALSE, ...)character (required): name of the PSL-file to be converted to CSV-files
logical (with default): enable/disable raw data
extraction. The PSL files imported into R contain an element $raw_data, which
provides a few more information (e.g., count errors), sometimes it makes
sense to use this data of the more compact standard values created by read_PSL2R
logical (with default): enable/disable the creation of single table with n rows and n columns, instead of separate data.frame objects. Each curve will be represented by two columns for time and counts
further arguments that will be passed to the function read_PSL2R and write_RLum2CSV
The function returns either a CSV-file (or many of them) or for the option
export = FALSE a list comprising objects of type data.frame and matrix
0.1.2
Kreutzer, S., 2023. convert_PSL2CSV(): Export PSL-file(s) to CSV-files. Function version 0.1.2. In: Kreutzer, S., Burow, C., Dietze, M., Fuchs, M.C., Schmidt, C., Fischer, M., Friedrich, J., Mercier, N., Philippe, A., Riedesel, S., Autzen, M., Mittelstrass, D., Gray, H.J., Galharret, J., 2023. Luminescence: Comprehensive Luminescence Dating Data Analysis. R package version 0.9.23. https://CRAN.R-project.org/package=Luminescence
## export into single data.frame
file <- system.file("extdata/DorNie_0016.psl", package="Luminescence")
convert_PSL2CSV(file, export = FALSE, single_table = TRUE)
#> $conv_ALU0016_psl
#> 1_USER_t 1_USER_cts 2_IRSL_t 2_IRSL_cts 3_USER_t 3_USER_cts 4_OSL_t
#> 1 1 0 1 16660 1 4 1
#> 2 2 -2 2 16129 2 10 2
#> 3 3 14 3 15860 3 -5 3
#> 4 4 7 4 15773 4 -1 4
#> 5 5 6 5 13509 5 -8 5
#> 6 6 -7 6 15171 6 -6 6
#> 7 7 -1 7 15025 7 13 7
#> 8 8 6 8 14753 8 5 8
#> 9 9 -8 9 14438 9 -24 9
#> 10 10 3 10 14205 10 11 10
#> 11 11 -2 11 14048 11 9 11
#> 12 12 6 12 13886 12 7 12
#> 13 13 0 13 13769 13 -8 13
#> 14 14 6 14 13619 14 -12 14
#> 15 15 -3 15 13365 15 -7 15
#> 16 NA NA 16 12847 NA NA 16
#> 17 NA NA 17 12967 NA NA 17
#> 18 NA NA 18 12693 NA NA 18
#> 19 NA NA 19 12726 NA NA 19
#> 20 NA NA 20 12663 NA NA 20
#> 21 NA NA 21 12740 NA NA 21
#> 22 NA NA 22 12394 NA NA 22
#> 23 NA NA 23 12142 NA NA 23
#> 24 NA NA 24 12139 NA NA 24
#> 25 NA NA 25 11967 NA NA 25
#> 26 NA NA 26 11870 NA NA 26
#> 27 NA NA 27 11836 NA NA 27
#> 28 NA NA 28 11673 NA NA 28
#> 29 NA NA 29 11539 NA NA 29
#> 30 NA NA 30 11513 NA NA 30
#> 31 NA NA 31 11443 NA NA 31
#> 32 NA NA 32 11391 NA NA 32
#> 33 NA NA 33 11263 NA NA 33
#> 34 NA NA 34 11128 NA NA 34
#> 35 NA NA 35 11026 NA NA 35
#> 36 NA NA 36 10991 NA NA 36
#> 37 NA NA 37 10798 NA NA 37
#> 38 NA NA 38 10781 NA NA 38
#> 39 NA NA 39 10754 NA NA 39
#> 40 NA NA 40 10455 NA NA 40
#> 41 NA NA 41 10705 NA NA 41
#> 42 NA NA 42 10457 NA NA 42
#> 43 NA NA 43 10358 NA NA 43
#> 44 NA NA 44 10578 NA NA 44
#> 45 NA NA 45 10543 NA NA 45
#> 46 NA NA 46 10260 NA NA 46
#> 47 NA NA 47 10263 NA NA 47
#> 48 NA NA 48 10209 NA NA 48
#> 49 NA NA 49 9936 NA NA 49
#> 50 NA NA 50 9943 NA NA 50
#> 51 NA NA 51 9782 NA NA 51
#> 52 NA NA 52 9836 NA NA 52
#> 53 NA NA 53 9876 NA NA 53
#> 54 NA NA 54 8814 NA NA 54
#> 55 NA NA 55 9854 NA NA 55
#> 56 NA NA 56 9571 NA NA 56
#> 57 NA NA 57 9581 NA NA 57
#> 58 NA NA 58 9433 NA NA 58
#> 59 NA NA 59 9568 NA NA 59
#> 60 NA NA 60 9466 NA NA 60
#> 61 NA NA 61 9362 NA NA 61
#> 62 NA NA 62 9267 NA NA 62
#> 63 NA NA 63 9240 NA NA 63
#> 64 NA NA 64 9425 NA NA 64
#> 65 NA NA 65 9129 NA NA 65
#> 66 NA NA 66 9132 NA NA 66
#> 67 NA NA 67 9036 NA NA 67
#> 68 NA NA 68 9166 NA NA 68
#> 69 NA NA 69 8859 NA NA 69
#> 70 NA NA 70 8973 NA NA 70
#> 71 NA NA 71 8914 NA NA 71
#> 72 NA NA 72 8921 NA NA 72
#> 73 NA NA 73 8819 NA NA 73
#> 74 NA NA 74 8935 NA NA 74
#> 75 NA NA 75 8711 NA NA 75
#> 76 NA NA 76 8862 NA NA 76
#> 77 NA NA 77 8847 NA NA 77
#> 78 NA NA 78 8611 NA NA 78
#> 79 NA NA 79 8785 NA NA 79
#> 80 NA NA 80 8583 NA NA 80
#> 81 NA NA 81 8340 NA NA 81
#> 82 NA NA 82 8481 NA NA 82
#> 83 NA NA 83 8525 NA NA 83
#> 84 NA NA 84 8286 NA NA 84
#> 85 NA NA 85 8547 NA NA 85
#> 86 NA NA 86 8292 NA NA 86
#> 87 NA NA 87 8415 NA NA 87
#> 88 NA NA 88 8231 NA NA 88
#> 89 NA NA 89 8054 NA NA 89
#> 90 NA NA 90 8489 NA NA 90
#> 91 NA NA 91 8075 NA NA 91
#> 92 NA NA 92 8076 NA NA 92
#> 93 NA NA 93 8048 NA NA 93
#> 94 NA NA 94 7913 NA NA 94
#> 95 NA NA 95 7952 NA NA 95
#> 96 NA NA 96 7993 NA NA 96
#> 97 NA NA 97 7914 NA NA 97
#> 98 NA NA 98 7909 NA NA 98
#> 99 NA NA 99 7863 NA NA 99
#> 100 NA NA 100 7966 NA NA 100
#> 4_OSL_cts 5_USER_t 5_USER_cts
#> 1 88023 1 -22
#> 2 85585 2 -1
#> 3 83394 3 25
#> 4 80840 4 0
#> 5 78826 5 12
#> 6 76523 6 4
#> 7 74442 7 12
#> 8 72370 8 -13
#> 9 70429 9 26
#> 10 69502 10 -16
#> 11 67389 11 -26
#> 12 65571 12 -12
#> 13 64550 13 28
#> 14 62602 14 -8
#> 15 61530 15 -10
#> 16 59973 NA NA
#> 17 58776 NA NA
#> 18 56702 NA NA
#> 19 56463 NA NA
#> 20 55544 NA NA
#> 21 54560 NA NA
#> 22 53655 NA NA
#> 23 51510 NA NA
#> 24 51533 NA NA
#> 25 50612 NA NA
#> 26 49634 NA NA
#> 27 48865 NA NA
#> 28 47477 NA NA
#> 29 47611 NA NA
#> 30 46493 NA NA
#> 31 46228 NA NA
#> 32 45406 NA NA
#> 33 44412 NA NA
#> 34 43986 NA NA
#> 35 42660 NA NA
#> 36 42668 NA NA
#> 37 42134 NA NA
#> 38 41714 NA NA
#> 39 41122 NA NA
#> 40 40480 NA NA
#> 41 39864 NA NA
#> 42 39509 NA NA
#> 43 38667 NA NA
#> 44 34400 NA NA
#> 45 37490 NA NA
#> 46 37932 NA NA
#> 47 37080 NA NA
#> 48 36770 NA NA
#> 49 35939 NA NA
#> 50 35905 NA NA
#> 51 35136 NA NA
#> 52 34799 NA NA
#> 53 34099 NA NA
#> 54 33965 NA NA
#> 55 33632 NA NA
#> 56 33346 NA NA
#> 57 32733 NA NA
#> 58 32818 NA NA
#> 59 31939 NA NA
#> 60 31811 NA NA
#> 61 31846 NA NA
#> 62 31014 NA NA
#> 63 31358 NA NA
#> 64 30640 NA NA
#> 65 30371 NA NA
#> 66 30182 NA NA
#> 67 29531 NA NA
#> 68 29751 NA NA
#> 69 29212 NA NA
#> 70 28599 NA NA
#> 71 28182 NA NA
#> 72 28644 NA NA
#> 73 28154 NA NA
#> 74 27587 NA NA
#> 75 27537 NA NA
#> 76 27275 NA NA
#> 77 27064 NA NA
#> 78 27142 NA NA
#> 79 26655 NA NA
#> 80 26503 NA NA
#> 81 26296 NA NA
#> 82 25213 NA NA
#> 83 25774 NA NA
#> 84 24724 NA NA
#> 85 25337 NA NA
#> 86 25361 NA NA
#> 87 24962 NA NA
#> 88 24411 NA NA
#> 89 24427 NA NA
#> 90 24599 NA NA
#> 91 24128 NA NA
#> 92 23943 NA NA
#> 93 21914 NA NA
#> 94 23812 NA NA
#> 95 23516 NA NA
#> 96 23346 NA NA
#> 97 22965 NA NA
#> 98 22955 NA NA
#> 99 22828 NA NA
#> 100 22552 NA NA
#>
if (FALSE) {
##select your BIN-file
file <- file.choose()
##convert
convert_PSL2CSV(file)
}